提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******
近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。
全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。
统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。
相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。
该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。
与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。
该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。
学术支持
中国农业科学院作物科学研究所
记者
宋雅娟
特朗普谈2024共和党总统候选人提名：不是他就单干？ ******
中新网2月3日电 综合报道，特朗普2日拒绝承诺，如果他没有获得美国共和党下届总统候选人提名，是否还会支持获得提名者。分析称，这暴露出共和党在2024年入主白宫的道路上可能陷入的“泥潭”。
当地时间2022年11月15日，美国前总统特朗普在佛罗里达州海湖庄园发表演讲，正式宣布将参加2024年美国总统大选。据报道，当被问及是否会支持赢得共和党党内提名的“任何人”时，特朗普告诉保守派电台主持人休·休伊特，“这要看情况。答案和我在2016年参加总统初选辩论时的回答一样。”他补充说，“这将取决于提名人是谁。”
特朗普发表这番言论之前，前马里兰州长拉里·霍根(Larry Hogan)透露，他正在权衡是否参加2024年美国总统竞选。霍根说，他不相信特朗普会成为共和党的提名人，但他会支持任何一位提名者。据悉，霍根是特朗普的批评者。
分析称，特朗普的表态突显出一些共和党人的担心，即若特朗普未赢得提名，他将以第三方候选人的身份参选，这将把大量忠于特朗普的共和党初选选民吸走。
《纽约时报》还指出，若特朗普开展独立竞选活动，将分裂共和党的基本盘，几乎可以确保民主党人在白宫再执政四年。
本周的一项民意调查发现，多数共和党人希望特朗普以外的人成为该党的下一任总统候选人。但民调还显示，28%的共和党选民愿意在独立竞选中支持特朗普。
截至目前，特朗普是共和党方面唯一宣布参选的人。前南卡州长、特朗普政府时期驻联合国大使海莉预计将在2月15日宣布参选。其他可能参选的共和党人包括佛州州长德桑蒂斯、国会参议员蒂姆·斯科特、前国务卿蓬佩奥和前副总统彭斯。
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